2025-07-23 ⋯ netMHCpan 작업 #2 HLA-I 펩타이드 추출
Patient id 추출 result 환자별 proteome.fasta와 HLA-I 펩타이드 생성 epitope.bash sc1.py result
2025-07-23 ⋯ netMHCpan 작업 #1 환자 시퀀스 생성
path Load package Load data Make allprot.fasta result
2025-06-27 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #6 HLA 결합력 변화 비교
1. Load package 2. Load affinity data 3. Merge affinity tables 만든건 저장. 4. Load peptide data 5. Merge peptide data 6. Check affinity between moderate and severe group
2025-06-24 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #5 결과 검증: 계통 결정 돌연변이와 연관성
1. Load package 2. Load data 만든건 저장.
2025-06-24 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #4 알고리즘 성능 평가 - k dist plot
1. Load package 2. Load data 3. K-dist plot
2025-06-20 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #3 결과 검증: 임상 결과와의 연관성
1. Load package 2. Load COVID19 data 3. Select severity related hotspots 만든건 저장하기.
2025-06-20 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #2 변이 중요도 계산
1. Load package 2. Load GISAID data 3. Calculate H-score 4. Save
2025-06-20 ⋯ 변이 클러스터링 연구 #1 알고리즘 실행
1. Load package 2. Find CCMs 3. Perform clustering